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转移性结直肠癌临床诊断靶基因分析

摘要 : 目的:谈讨结直肠癌转移的 miRNA 参与分子机制,寻找临床新的诊断靶基因。方法:从 GES48074 芯片数据集中筛选差异表达 miRNA,利用 mirwalk 预测靶基因,构 建构建 miRNA-靶基因调控网络和转录因子-miRNA 调控网络,并分别构建蛋白互作(PPI)网络选取核心蛋白。结果:筛选得到差异表达 miRNA44 个,16 个核心靶蛋白,主要包 括 PTEN、PIK3R1、APK14、FYN、GNAS 等。结论:核心基因 GNAS、PIK3R1 的表达水平与结直肠癌转移显著相关。

  • 作者 : 娄子衡 应南娇 * 金莹
  • 作者单位 : 杭州电子科技大学自动化学院 浙江杭州 310018
  • 关键字 : 结直肠癌;GEO 数据库;miRNA;靶点预测,调控网络
  • 刊名 : 健康忠告
  • 年,卷(期) : 2020 , 12
  • 所属期刊栏目 : 药物与临床
  • 基金项目 :
  • 在线出版日期 : 2021-01-12
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